Biomodifikacija se nanaša na encimsko obdelavo škroba z uporabo različnih encimov; primeri, kot so ciklodekstrini, maltodekstrini in amiloza, so vsi modificirani škrobi, proizvedeni z encimsko obdelavo. Encimska modifikacija se izvaja v blagih pogojih, je okolju prijazna in ne-onesnažuje ter daje modificirane škrobe, ki so varni in higienski. Ko se ti modificirani škrobi zaužijejo kot sestavine hrane, jih človeško telo zlahka prebavi in absorbira ter imajo edinstvene fiziološke funkcije.
Encimska hidroliza škroba trpotca z uporabo srednje{0}}temperaturne -amilaze in glukoamilaze omogoča zadrževanje odporne škrobne frakcije škroba ob hkratnem spreminjanju ne-odpornih škrobnih komponent. Rezultat tega procesa so modificirana škrobna zrnca, za katera so značilne pore, bolj gladka morfologija, zmanjšana velikost delcev in razmeroma enakomerna porazdelitev velikosti. Sakina Khatoon idr. obdelan škrob z -amilazo za proizvodnjo škrobnih hidrolizatov z nizkimi vrednostmi glukoze; predvsem delno hidroliziran škrob je vseboval oligosaharide s široko porazdelitvijo molekulske mase. Ti oligosaharidi lahko maščobnim nadomestkom dajejo potrebne funkcionalne lastnosti.
